Kollarčíková M., Faldynová M., Matiašovicová J., Jahodářová E., Kubasová T., Seidlerová Z., Babák V., Čížek A., Rychlík I. Střevní mikroflóra kuřat a lidí obsahuje odlišné druhy rodu Bacteroides. Chicken and human gut microbiota consists of different Bacteroides species. Veterinářství 2021;71(4):215-217.
SOUHRN
V této práci jsme sledovali hostitelskou adaptaci bakteriálních druhů střevní mikroflóry náležících do čeledi Bacteroidaceae. Bacteroides dorei, B. uniformis, B. xylanisolvens, B. ovatus, B. clarus, B. thetaiotaomicron a B. vulgatus jsme zachytili ve vzorcích z člověka, zatímco B. gallinaceum, B. caecigallinarum, B. mediterraneensis, B. caecicola, M. massiliensis, B. plebeius a B. coprocola se běžně nacházely v mikroflóře kura domácího. Porovnáním genomů druhů jsme zjistili, že u všech druhů adaptovaných na člověka se vyskytovalo 29 genů, které se vůbec nevyskytovaly u kuřecích druhů. U druhů adaptovaných na kuře jsme neidentifikovali žádný gen, který by se vyskytoval u všech “kuřecích” druhů a chyběl
u druhů adaptovaných na člověka. U druhů adaptovaných na kuře jsme však identifikovali geny (např. KUP, linA nebo sugE), které se sice nevyskytovaly u všech druhů, ale pokud se vyskytly, vykazovaly 99–100% podobnost. Jejich vysoká vzájemná podobnost indikuje, že se mezi bakteriemi kuřecí mikroflóry šíří horizontálním přenosem.
SUMMARY
In this study we evaluated host adaptation of bacterial species belonging to the family Bacteroidaceae. B. dorei, B. uniformis, B. xylanisolvens, B. ovatus, B. clarus, B. thetaiotaomicron and B. vulgatus represented human-adapted species while B. gallinaceum, B. caecigallinarum, B. mediterraneensis, B. caecicola, M. massiliensis, B. plebeius and B. coprocola were commonly detected in chicken but not human gut microbiota. There were 29 genes which were present in all human-adapted Bacteroides but were absent from the genomes of all chicken isolates, and these included genes required for the pentose cycle and glutamate or histidine metabolism. Not a single gene specific for the chicken-adapted species was found. Instead, chicken-adapted species exhibited signs of frequent horizontal gene transfer, of KUP, linA and sugE genes in particular.*
